有鉴于这方面的担心，老蒋最后对欧阳云说道：“欧阳老弟，不管以前我们之间有什么矛盾，国难当前，我还是希望能够携起手来共度时艰。如你所说，南京肯定守不住的，也没有守卫的价值，一旦主力部队撤退完毕，你们就抓紧时间撤吧。闽粤一带，最终还需要你去掌握。切记，注意个人安危。小鬼子对你可是恨之入骨哪！”
对于老蒋的好意，欧阳云诚挚的感谢道：“委员长，多谢您的关怀，我会量力而为的。”
老蒋带人离去以后，张少帅又拉着欧阳云说了一番话。他对欧阳的关心，其性质自然不是老蒋所能比拟的，作为一起患过难的战友，他是真心希望欧阳云能够小心一点，为此，甚至不惜将东北军这次南援南京的五个师中最为精锐的两个师留给了他，而且当着他的面，要求那两个师长以后唯欧阳云马首是瞻。
中国军队的撤退举动，自然不可能瞒过日军。毕竟，有侦察机时时刻刻的关注着南京局势，可以说，中国军队大规模的军事调动无一例外的都落进了日军的眼中。而让欧阳云感到奇怪的是，面对如此好的良机，日军竟然稳住了气按兵不动，也不知道究竟打的什么主意。
欧阳云升任南京卫戍司令以后，下辖十个师，其中，川军两个师，东北军两个师，学兵军三个师，原属于南京卫戍司令部的保安部队一个师，再加上隶属于军事委员会直接统辖的两个师。
在中央军开始脱离战场，陆续朝内地撤退的时候，欧阳云并没有急着撤离民众，而是首先对下面的部队重新进行了编组。
老蒋拨给欧阳云的军队中，因为并没有所谓的王牌部队，如此一来，虽然战斗力并不能保证，但是，却也没有多少骄横之气，总的来说，对于这位年轻的南京卫戍司令，还是抱有一定的畏惧之心的。当然，这或许和李汉魂在会议上的那番激励的言辞有关——既然欧阳云拥有绝对的生杀大权，再借鉴此人以前的表现，不管是川军还是中央军抑或是保安部队，所有的师长旅长们，自然觉得还是少招惹他为妙。
重新编组以后的南京卫戍部队，以防地为区别，总共分为两个部位，其中，以一个川军师一个东北军师，两个学兵军构成了最外围的防线。他们将负责城墙段的防守。而围绕着紫金山，则建立了一道由一个川军师、一个学兵师和一个东北军师构成的第二道防线。至于两个师的中央军和一个师的保安部队，则担纲预备队的角色。
在当天卫戍司令部召开的第一次旅长以上级别的军官会议上，当欧阳云将这个编组方案公布出来的时候，如他所料，立刻遭到了那两个中央军上的师旅长们的反对。他们反对的理由很简单——欧阳司令太看不起人了，凭什么自己的部队就要担纲预备队，是觉得我们打仗不行吗？
这却是冤枉欧阳云了，因为这个方案，其实是他和李汉魂还有吴克仁、方叔洪（东北军的两个师长，其中，吴克仁还兼六十七军副军长，此两人皆为爱国将领，少帅留这两个人给欧阳云，可见其确实是向着学兵军的）、饶国华（川军一四五师师长）、刘雨卿（川军二十六师师长）等人协商之后的出来的。当然，中央军能有这样的情绪，对于欧阳云来说，却是好事。
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