此后，他和他的部下，数十名电台监听员、密码破译员、翻译和情报分析员，在警卫森严的威海军港第14海军军区司令部大楼的地下室里夜以继日地工作，他们的工作环境几乎与世隔绝，每周工作时间高达八九十小时，海军百分之90的电讯往来都被他们所截获。
海军此时使用的代号为JN25B密码，该密码系统主密码是由4.5万个五位数数码组组成，为增加安全保障，还配有五万组五位数乱编数码组，通信时发信方加入任意几组乱码数。其中一组告之收信方使用密码本的页数、段数，乱编数码组经常变更，但是主密码基本不变，这就大大便利了戴笠的破译工作。
尤其是在今年5月，在与澳大利亚的一次海战中，在菲律宾海域沉没了一艘军舰，中国随即派出蛙人潜入海底，意外的打捞起了JN25B密码本，使戴笠的破译工作获得了飞跃性的进展，至此，中国已经能够了解海军大部分通信秘密。
更为幸运的是，日军原定于启用新的JN25C密码，由于日军在太平洋上的迅猛发展，占领区面积十分广阔，要将新密码分送到分散在各地的部队手中，需要不少时间，因此日军将新密码的启用时间推迟，这就使得日军在济州岛作战准备期间的大量电信往来，都不得不使用旧密码。
戴笠于6月20日截获并基本破译出联合舰队司令下发给各部队的长篇电文，掌握了日军的作战计划，只是由于日军始终用AF作为战役目标的代号，还无法确定哪里是日军的进攻目标。但戴笠根据电报的命名习惯，坚定的认为AF是济州岛。记忆力过人的戴笠还从浩如烟海的电文中找到前不久的一份日军电报，电报是要求水上飞机从马绍尔群岛起飞，中途在弗里格特珊瑚礁从潜艇上接受燃料补给，再飞往鹤舞军港，电文还提到要注意避开来自AF的空中侦察，从地图上分析AF只能是济州岛！
威海海军第17司令部里，帝国海军部参谋长林建章正在召开一次重要军事会议。
“人的舰队是不是全部出动了？济州岛能不能守住？我们有没有相应的措施？本土舰队最近的部队在哪里？”一个个问题如同连珠炮一样砸在了林建章的头上。
“全部都静一静！”林建章的声音很大，而且猛力敲着桌子，看得出来他此时的心情很焦躁。他努力平静了一下自己的心绪，这才开口说到：“根据我们的情报表明，人出动了全部的主力舰队，势必要夺下济州岛，此外我们还发现原本在舞鹤港停泊的四艘最强的战列舰大和号等也消失了。我们的海面侦察部队正在竭力的搜索，可是还没有发现对方。我认为他们也许正在难免的某个地方等待迂回过来。最有可能的是，在爪哇一线，因为那里有他们的基地支援。但是也不排除在菲律宾海域。”
林建章略微停顿了一下，接着说道：“至于舰队的数量，由于人的动作比较突然，所以我们的舰队并没有完全准备完毕。北洋舰队的主力就要到达济州岛了，但是南洋舰队还在海路上奔波，所以我建议先等一等，等到我们的舰队完全集中完毕之后，再对人发动攻势。这样，我们的损失会小很多。”
“不行！绝对不行！因为这样一来我们就没有时间了。人已经控制了太平洋南部和东部海域，那里已经变成了军舰的游猎区，我们必须赶在人抵达济州岛之前，利用我们压倒性的优势一举消灭对方。首先我们必须夺取朝鲜南部沿海的制海权，特别是面向航线的制海权，这条航线对我们来说非常的重要，所以我要求你们乘着海军立足未稳，尚未到达之前，分兵两路，一路抵御舰队的进袭，另一路向西部海岛发动攻击，重创敌人的军港。”海军装备部部长叶祖珪坚持着自己的意见。
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