在前往下一个岛屿的船上，小智一行人遇到曾经见过面的跳跳猪。跳跳猪一不小心又把头顶的珍珠弄丢了，而且还是掉进了海中。小智和明龖派出水属性宝可梦去寻找珍珠，可是怎么也找不到。他们不得不在瑞弗勒岛停了下来，就在他们苦恼的时候，一名叫做伊崎的珍珠贝研究员告诉他们可以用珍珠贝的珍珠代替跳跳猪的珍珠。
瑞弗勒岛也是位于水静市和绿岭市之间，不过是在邦巴岛的后面，由于这里盛产珍珠贝，所以又被称作珍珠贝之岛。岛上珍珠贝的研究所位于岛屿悬崖上的建筑物里，里面有着一座人工湖，里面生存着许多的珍珠贝，在旁边的展览柜里还有一颗蓝色的珍珠贝，变色过程无人知晓，明龖也是搞不懂，异色的珍珠贝珍珠应该是黄色的。
珍珠贝有粉红色的本体，周围围着蓝色的类似用来保护的东西，会利用它的壳来夹住猎物，让猎物无法逃走，进化时所产生的珍珠据说拥有不可思议的力量。自身的进化又和两个道具深海之牙以及神话鳞片有不小的关系，单独携带也是会有加成。
如此特别的大珍珠肯定是会被火箭队看上的，跳跳猪也是很期待，因此跳跳猪用精神强念在火箭队的面前拿走了蓝珍珠，接着，由于跳跳猪跌倒，蓝珍珠和一只珍珠贝里的粉色珍珠掉包了。小智他们来到了珍珠贝的所在地——盐水浴场那里找到了珍珠贝，跳跳猪也愿意交换，但这时，火箭队突然冲出来，抢走了珍珠贝。不过珍珠贝不愿意打开贝壳，火箭队绞尽脑汁也无法打开，这时侦查中的小智的大王燕发现了他们，小智一行人也赶到，在跳跳猪的协助下赶走了火箭队，之后，蓝珍珠物归原主，伊崎的研究也可以继续下去，而珍珠贝也愿意把珍珠送给跳跳猪，好人更容易获得皆大欢喜的结局。
跳跳猪与珍珠贝的关系，在图鉴信息明确写着跳跳猪头上顶着珍珠贝的珍珠，而珍珠贝的图鉴上则写着其一生只能制作一颗珍珠，也就是说跳跳猪的珍珠如果真的来自于珍珠贝的话，跳跳猪和珍珠贝应该存在某种特殊的关系；而跳跳猪是否在得到珍珠过程中都需要找到珍珠贝也值得疑问（也是存在一些死亡个体），而这一边很可能就是因为跳跳猪想要找到新的更大的珍珠，所以小智一行人才会看到它在海里漂流—因为珍珠贝都栖息在海里。不过珍珠贝和跳跳猪明显无法形成共生合作关系（跳跳猪不会给珍珠贝带来好处），所以珍珠贝为何会心甘情愿把珍珠让给跳跳猪，算是一个需要好好研究的迷。
不可思议的宝可梦，它们之间的关系同样非常的不可思议；呆呆兽与大舌贝最为出名，它俩凑到一起是进化还是共生，不过它们可以退化是个事实。呆呆兽的进化方式不同于大多数精灵：大舌贝咬住呆呆兽的尾巴，便能让它进化；当呆呆兽把尾巴放到水里，不凑巧钓上一只大舌贝的时候，那恭喜，它进化了。进化成呆河马后，大舌贝会变成一种全新的生物，本以为是大舌贝的分支进化，然而并没有出现在图鉴上；其实这种“形态”的大舌贝还是挺细思极恐的，附着到其他生物后，样貌特征全变了，但是在宝可梦的世界中，大家都觉得还算合理。宝可梦学术权威西野森博士曾经专门研究过呆呆兽和大舌贝的关系，也没能指出大舌贝“变化”的原因，很多的小奇妙印证不可思议的宝可梦世界。
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